第二军医大学学报是由第二军医大学（海军军医大学）主办、国内外公开发行的学术期刊，国内统一连续出版物号为31-1001/R，国际标准连续出版物号为0258-879X，出版周期为月刊，长期聚焦自然科学与工程技术、医药卫生科技、医药卫生综合等前沿动态与实践创新，重点刊发原创性研究论文、综述报告、案例分析及教学方法探讨等成果。
第二军医大学学报一级发文领域广泛涵盖医药卫生、生物学、哲学宗教、文化科学、化学工程、语言文字、理学、电子电信、一般工业技术、电气工程等学科门类，主要刊载这些领域下的基础理论、应用研究与前沿交叉成果。为进一步明确收稿方向，本刊基于近年来的发文量与学术被引表现，在二级发文层面上重点关注但不限于以下具体方向：医药卫生 / 临床医学、医药卫生 / 内科学、医药卫生 / 肿瘤、医药卫生 / 外科学、医药卫生 / 基础医学、医药卫生 / 药学、医药卫生 / 心血管疾病、医药卫生 / 神经病学与精神病学、医药卫生 / 药品、医药卫生 / 骨科学。投稿文章须属于上述一级发文领域中的任一学科，并且研究主题明确归属于所列二级方向之一，或与之紧密相关。对于明显偏离上述一级领域或二级方向的稿件，编辑部将作退稿或建议转投处理。本刊鼓励作者在投稿前仔细比对自己的研究主题是否与上述高发文量、高被引量的方向相契合，以提升稿件送审与录用的效率。
第二军医大学学报主要资助课题包括：上海市卫生系统百名跨世纪优秀学科带头人培养计划(97BR047)、上海市市级医院新兴前沿技术联合攻关项目(SHDC12010115)、军队杰出人才基金(98J005)、上海市科学技术发展基金(004419029)、军队临床高新技术重大项目(2010gxjs057)、国家自然科学基金(70333002)、国家自然科学基金(81171436)、上海市卫生系统百名跨世纪优秀学科带头人培养计划(98BR029)、上海市教育发展基金会“曙光计划”项目(02SG30)、国家科技重大专项(2002AA2Z3130)。欢迎具有理论深度、实证支撑或交叉学科视角的稿件。投稿时请注意：稿件必须为未公开发表的原创作品，杜绝抄袭、剽窃等学术不端行为；严禁一稿多投，一经发现将立即退稿。第二军医大学学报全体编辑同仁期待海内外学者不吝赐稿，共同推动医药卫生科技行业领域的学术繁荣与创新发展。